Pengukuran Jurusan Berkinerja Terbaik (PJBT) adalah audit kepada jurusan secara rutin setiap tahun dimulai bulan Juli sampai September berdasarkan standar penilaian yang dikembangkan dari BAN-PT. Hasil pengukuran diumumkan pada saat acara Dies Natalis ITS.

Pemenang PJBT tahun 2013 sesuai dengan SK Rektor No 1097/SK/R/2013 tentang Penetapan Pemenang PJBT di Lingkungan ITS Tahun 2013.

• Katagori Umum, Juara 1 PJBT 2013 : Teknik Lingkungan, FTSP
• Katagori Umum, Juara 2 PJBT 2013 : Statistik, FMIPA
• Katagori Umum, Juara 3 PJBT 2013 : Teknik Informatika, FTIf
• Katagori Pendidikan, Juara 1 PJBT 2013 : Sistem Informasi, FTIf
• Katagori Pendidikan, Juara 2 PJBT 2013 : Teknik Sistem Perkapalan, FTK
• Katagori Manajemen, Juara 1 PJBT 2013 : Teknik Sipil, FTSP
• Katagori Manajemen, Juara 2 PJBT 2013 : Teknik Industri, FTI
• Juara Penelitian .PPM dan Kerja sama, Juara 1 PJBT 2013 : Teknik Kimia, FTI
• Juara Penelitian .PPM dan Kerja sama, Juara 2 PJBT 2013 : Teknik Mesin, FTI